Az Atromitos U20 egy görög labdarúgócsapat, amely az ifjúsági labdarúgó-bajnokságban játszik. A csapatot 2012-ben alapították, és az Atromitos FC ifjúsági akadémiájának része. A csapat otthoni mérkőzéseit a Peristeri Stadionban játssza.

Az Atromitos U20 több hazai trófeát is nyert, többek között az U20-as bajnokságot és az U20-as kupát. A csapat részt vett az UEFA Ifjúsági Ligában is, ahol a legjobb eredményt a 2018/19-es szezonban érte el, amikor az elődöntőig jutott.

Az Atromitos U20 több tehetséges játékost is kinevelt, köztük Kostas Manolát, aki a Napoli és a görög válogatott játékosa. A csapat edzője jelenleg Giorgos Alexopoulos.